Okulumuz 1995-1996 öğretim yılında ilimiz Karşıyaka Lisesi binası bünyesinde hizmete açılmış olup 2 yıl burada eğitim öğretimini sürdürmüştür. Daha sonra Elazığ Valiliği onayı ile ilimiz Yusuf Yakupoğlu ilköğretim okulu binasında bağımsız olarak eğitim öğretim hizmetlerine devam etmiştir..
Elazığ Anadolu Öğretmen Lisesi Olarak hizmetini sürdürürken Elazığ Valiliğinin 27.02.1997 tarih ve 460 / 550 sayılı teklifi ile Bakanlığımız tarafından hemşehrimiz gazeteci-yazar Şeyh'ül- Muharririn Ahmet Kabaklı'nın adı verildi. 05.06.2014 tarihine kadar Ahmet Kabaklı Anadolu Öğretmen Lisesi adıyla eğitim-öğretime devam edildi.
Ahmet Kabaklı Anadolu Öğretmen Lisesi adıyla eğitim–öğretim hayatını sürdürürken, 2004 yılında İMKB tarafından yaptırılan 17 derslikli okul binası ,120 erkek ,120 kız öğrenci kapasiteli iki adet pansiyonu , spor salonu ve yemekhanesi ile birlikte son derece modern bir eğitim kampüsüne kavuştu.
Okulumuz Milli Eğitim Bakanlığının 05.06.2014 tarih ve 83203306/10.03/2288835 sayılı onayı ile Anadolu Lisesine dönüştürülmüştür.
Okulumuz Milli Eğitim Bakanlığının 24.02.2020 tarih ve 69543144/105.01/4017101 sayılı onayı ile Fen Lisesine dönüştürülmüştür.
